More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2082 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 		 300 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  37.01 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  43.4 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.87 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.43 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.46 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.3 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  42.8 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  37.73 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  39.39 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.6 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.76 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.6 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  38.38 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.21 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  40.23 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  38.3 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.33 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  32.3 
 
 		 587 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  36.26 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.09 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  32.3 
 
 		 587 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.06 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  33.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.75 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.52 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  36.76 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.96 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  38.35 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.03 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  36.86 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  36.43 
 
 		 296 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  33.91 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  39.19 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  36.06 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  39.62 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  37.93 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.28 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.49 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  36.95 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.8 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  31.32 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  35.9 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.69 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.52 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  41.09 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.03 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.11 
 
 		 314 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  30.8 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  35.79 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  32.36 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  35.71 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  32.97 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.98 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.74 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  35.94 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  37.21 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38.96 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.66 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  35.81 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.57 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  32.62 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  35.92 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  32.51 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  34.97 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  33.68 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.94 
 
 		 288 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  38.59 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  33.83 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.84 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.08 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  32.84 
 
 		 283 aa  142  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1259  modification methylase, HemK family  36.97 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0145638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  31.07 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  30.56 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  33.33 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  31.56 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.18 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.64 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  36.07 
 
 		 292 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  31.48 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.93 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2488  HemK family modification methylase  33.01 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  32.12 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0293  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  36.6 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  34.05 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.68 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.49 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.64 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  35.84 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  34.47 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.51 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  37.32 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.21 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.23 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>