More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1942 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2109  elongation factor Ts  52.31 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0347  elongation factor Ts  51.6 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  50.88 
 
 		 267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  44.33 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  47.3 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  42.71 
 
 		 313 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  47.3 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.14 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  43.81 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  44.67 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  44.67 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  42.42 
 
 		 314 aa  222  6e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  41.47 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  40.2 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  43.05 
 
 		 312 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.61 
 
 		 288 aa  216  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  42.12 
 
 		 288 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  41.78 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  41.58 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  42.95 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  41.95 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  42.91 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.34 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  42.76 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  43.33 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  41.81 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  41.41 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.24 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  41.86 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2045  elongation factor Ts  40.67 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00216112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  41.41 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  44.14 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  41.67 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.8 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  40.69 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  43.67 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  40.69 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  43 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  42.33 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0706  translation elongation factor Ts  43.45 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000134038  unclonable  0.0000000259641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  40.73 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  42.57 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2734  translation elongation factor Ts  40.69 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  39.93 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.3 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1261  elongation factor Ts  37.86 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00427037  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 292 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  41.14 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  43.33 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  43 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  42.28 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  43.33 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  41.08 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  41.69 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  42.67 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.5 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  44.4 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  40.41 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  43.1 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  41.98 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  40.61 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  42.32 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  42.72 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  39.46 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  39.73 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  38.26 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  42.52 
 
 		 307 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1196  elongation factor Ts  35.73 
 
 		 357 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  38.23 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.98 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1315  elongation factor Ts  35.45 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  43.45 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  43.61 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0649  translation elongation factor Ts  37.91 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.301511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  40.47 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>