More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0282 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
350 aa  715    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  50.15 
 
 
372 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  54.41 
 
 
351 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  50.75 
 
 
341 aa  342  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  48.97 
 
 
348 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
344 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.19 
 
 
359 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.45 
 
 
352 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  26.8 
 
 
344 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  27.3 
 
 
360 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.35 
 
 
348 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  27.04 
 
 
335 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.65 
 
 
361 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.19 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.19 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.19 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.1 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.05 
 
 
360 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.19 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.21 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.62 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.93 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.21 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  26.14 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.52 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.21 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  27.09 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.21 
 
 
352 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.3 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3091  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  20.6 
 
 
359 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.53 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.77 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.17 
 
 
332 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.1 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  26.21 
 
 
359 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  24.29 
 
 
335 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.66 
 
 
356 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  25.97 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5441  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.986872  hitchhiker  0.00941835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.86 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.81 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.81 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6036  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
401 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.424999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.58 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  25.07 
 
 
352 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.36 
 
 
341 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  25.81 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.44 
 
 
341 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25 
 
 
367 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.37 
 
 
359 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.08 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.82 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.62 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  30 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  26.71 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.71 
 
 
516 aa  81.6  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.43 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0682  hypothetical protein  24.76 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.74 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.64 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.86 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  20.79 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.47 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.88 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  20.83 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.2 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.88 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  25.36 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2239  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
431 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.75 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  27.33 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  23.65 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0977  glycosyl transferase family 9  26.4 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.412214  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  21.51 
 
 
339 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5651  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.252333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.5 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.09 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.27 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  25.59 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  19.54 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  22.61 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  24.85 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  25.07 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0801  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.1 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  21.39 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  23.06 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>