More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3071 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  100 
 
 		 374 aa  770    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.98 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  45.09 
 
 		 374 aa  332  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.89 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.95 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  37.13 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  37.28 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  34.29 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.38 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  36.36 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  34.57 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.32 
 
 		 404 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  32.99 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  32.53 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  33.33 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  32.2 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.58 
 
 		 404 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  28.5 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  29.97 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  29.97 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  30.81 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  28.46 
 
 		 469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  26.3 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  24.15 
 
 		 441 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  30.27 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  53.91 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.4 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  45.22 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.9 
 
 		 305 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  51.97 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.75 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  52.38 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.13 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.07 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.82 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.15 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.81 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  51.22 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50.79 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  52.89 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  30.06 
 
 		 419 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  38.79 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  27.54 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  27.54 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  32.49 
 
 		 302 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  53.97 
 
 		 265 aa  130  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  40.28 
 
 		 582 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  27.2 
 
 		 344 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.76 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  46.77 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  50.83 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  48.36 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  52.17 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  49.23 
 
 		 216 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  48.15 
 
 		 529 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  48.89 
 
 		 523 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  50.78 
 
 		 452 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  43.9 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  53.04 
 
 		 446 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  26.11 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  51.97 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.58 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  51.18 
 
 		 271 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  52.54 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.15 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  46.83 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  46.77 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  46.83 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.95 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  32.42 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  27.43 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  51.59 
 
 		 290 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  43.29 
 
 		 328 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.57 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.97 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.97 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  46.77 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  46.4 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  52.89 
 
 		 386 aa  122  9e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.24 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  48.7 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  52.89 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.44 
 
 		 238 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  51.82 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  49.57 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.44 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.24 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.13 
 
 		 223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  32.51 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  25.9 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  52.14 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.74 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  29.97 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  47.41 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.94 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  27.72 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  48.41 
 
 		 346 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  52.07 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.72 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>