More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1183 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2624  putative prophage repressor  47.34 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.5 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  46.61 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.11 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  34.9 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  40.48 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.93 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  37.67 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  42.86 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  51.55 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  44.63 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.26 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  33.15 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31.98 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  40.3 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  35.9 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  40.3 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.73 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.56 
 
 		 269 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  38.52 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.56 
 
 		 269 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.74 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46 
 
 		 243 aa  85.1  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.56 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.56 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.56 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.56 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.5 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.56 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.56 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  37.23 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  46.08 
 
 		 250 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  39.02 
 
 		 241 aa  84.7  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  32.58 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  45.71 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  45.1 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  39.44 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  42.98 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.98 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  46 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  45.37 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.65 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  42.98 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.06 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.48 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  34.91 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.46 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  38.28 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.28 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.28 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.72 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  45.71 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.67 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  42.15 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  38.28 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.5 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  40 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.28 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  34.62 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  34.67 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  38.84 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  35.92 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  42.16 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  45 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  34.62 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.83 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  35.14 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  42.59 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  39.39 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  32.95 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  38.3 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  39.84 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  39.39 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  40.95 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  37.9 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  40.35 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  40.5 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  37.1 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  40.65 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.43 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  41.44 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.23 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.33 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  39.68 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.34 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  42 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.25 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  36 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.72 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0426  transcriptional repressor, LexA family  39.69 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.3 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  35.34 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>