More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0901 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  100 
 
 		 407 aa  851    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  55.77 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  56.05 
 
 		 404 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  55.53 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  52.96 
 
 		 406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  51.98 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  50.98 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  51.6 
 
 		 409 aa  441  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  51.6 
 
 		 409 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  50.86 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  49.26 
 
 		 411 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  50.49 
 
 		 403 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  49.14 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  48.64 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  49.38 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  49.14 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  48.77 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  46.57 
 
 		 426 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  46.57 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  47.73 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  49.26 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  50.99 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  50.74 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  46.57 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  48.52 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  48.52 
 
 		 422 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  50.69 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  47.04 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  47.42 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  47.17 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  46.55 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  45.5 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  43.07 
 
 		 427 aa  358  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  43.03 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  45.61 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  43.49 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  42.75 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  45.19 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  42.68 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  40.37 
 
 		 453 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  45.45 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  42.21 
 
 		 418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  38.64 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  41.75 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  41.87 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  39.4 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  39.26 
 
 		 442 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  40.85 
 
 		 862 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  39.45 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  39.51 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  38.27 
 
 		 463 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  39.45 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  39.45 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  39.45 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  39.36 
 
 		 455 aa  292  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  38.23 
 
 		 450 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  39.34 
 
 		 455 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  37.78 
 
 		 453 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  39.12 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  37.96 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  38.86 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  38.58 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  39.06 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  38.5 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  38.86 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  37.25 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  37.27 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  37.14 
 
 		 471 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  38.61 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  38.61 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  37.64 
 
 		 454 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  38.37 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  37.53 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  36.01 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  37.53 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  37.53 
 
 		 464 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  38.37 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  36.01 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  37.16 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  38.67 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  38.53 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  37.92 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  45.14 
 
 		 783 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  37.9 
 
 		 453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  37.9 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  37.98 
 
 		 469 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  45.82 
 
 		 548 aa  282  8.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  40.77 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  38.43 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1829  peptidase U32  39.91 
 
 		 444 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  38.21 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  40.05 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>