196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0744 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
418 aa  865    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  52.23 
 
 
418 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  48.35 
 
 
426 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  35.86 
 
 
521 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  27.39 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  45.69 
 
 
495 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  43.07 
 
 
259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  40.94 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  38.19 
 
 
483 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  49.02 
 
 
216 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  42.48 
 
 
175 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.9 
 
 
907 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  35.34 
 
 
450 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  39.55 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  41.44 
 
 
282 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  31.97 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  37.84 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  42.99 
 
 
113 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  42.98 
 
 
535 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
456 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  33.54 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  37.5 
 
 
763 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  38.05 
 
 
792 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  38.46 
 
 
263 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32.89 
 
 
331 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  36.62 
 
 
269 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  36.62 
 
 
269 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  31.19 
 
 
591 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  41.03 
 
 
758 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
480 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  37.32 
 
 
269 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  26.81 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  35.65 
 
 
948 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.93 
 
 
657 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  36.76 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  35.48 
 
 
650 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  35.78 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  36.76 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  33.94 
 
 
763 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  34.75 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  34.51 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 
1176 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
143 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  29.85 
 
 
549 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 
541 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.66 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  35.51 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  34.55 
 
 
741 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  36.76 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  30.56 
 
 
574 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  35.78 
 
 
784 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  33.8 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  25.33 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  32.88 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  37.86 
 
 
732 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  35.83 
 
 
383 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  35.94 
 
 
251 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  42.31 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 
704 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  36.63 
 
 
514 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 
657 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  34.17 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  28.95 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  33.62 
 
 
781 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  34.41 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  29.58 
 
 
502 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  33.98 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  32.89 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  34.33 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  26.8 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  33.64 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  32.03 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  30.71 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 
746 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  34.29 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  30.32 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  31.61 
 
 
182 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  26.41 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  31.93 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  28.47 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  28.9 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  32.77 
 
 
176 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  28.68 
 
 
950 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  31.86 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  33.65 
 
 
304 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  30.92 
 
 
625 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  35.92 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  38.39 
 
 
751 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  35.79 
 
 
845 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  32.38 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  28.8 
 
 
547 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.5 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>