More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2757 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
329 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
329 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 
324 aa  401  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
330 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
327 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 
327 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.36 
 
 
327 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 
326 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
327 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
329 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 
330 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 
330 aa  378  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 
326 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
359 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
325 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.1 
 
 
329 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
329 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 
329 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
332 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
327 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
328 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
330 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 
329 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
328 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
331 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
329 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
331 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
340 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
340 aa  345  5e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 
354 aa  344  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
331 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
328 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 
328 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
348 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
327 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  49.09 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
333 aa  325  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
340 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
340 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
323 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
404 aa  315  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
405 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
323 aa  312  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
400 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  48 
 
 
325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
400 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
373 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
400 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
400 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
404 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
404 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
404 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
331 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
400 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
400 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
333 aa  275  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
400 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
400 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
400 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
400 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
400 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
403 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
403 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
392 aa  265  7e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
335 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
391 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
335 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.86 
 
 
402 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
400 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.47 
 
 
342 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
346 aa  249  4e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
356 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
356 aa  249  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
352 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.27 
 
 
346 aa  236  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>