More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1116 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 		 297 aa  318  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  53.72 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 		 296 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  48.47 
 
 		 301 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 301 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 299 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  47.46 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  48.97 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 		 296 aa  287  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  45.3 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 		 302 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 299 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 299 aa  271  8.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 297 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  46.78 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  47.37 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  47.37 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  44 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  43.3 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  48.48 
 
 		 294 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  44.18 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  45.92 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  45.73 
 
 		 301 aa  255  8e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  47.3 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  43.41 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  44.7 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  44.93 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  47.69 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  45.82 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  41.92 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  40.75 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  42.76 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 		 308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 311 aa  244  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  46.6 
 
 		 298 aa  244  9e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  45.17 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  43.33 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  45.55 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  41.58 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  45.17 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  45.24 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  42.12 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 		 324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2250  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  40.07 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  43.92 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4682  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  0.813655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  43.49 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  41.59 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  41.98 
 
 		 300 aa  237  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  41.1 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>