More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0234 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.93 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  44.33 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  40.98 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  40.98 
 
 		 223 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  40.98 
 
 		 223 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  40.98 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  40.98 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  40.98 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  40.98 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  40.49 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  40.98 
 
 		 269 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  41.46 
 
 		 204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  40.98 
 
 		 269 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  41.26 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  42.86 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  40.98 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  41.29 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  41.38 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  41.35 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.35 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.72 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.2 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 		 201 aa  141  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.98 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.49 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  40.29 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  37.98 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  38.76 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  38.76 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.44 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.75 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.26 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  40.39 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  38.19 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  38.86 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  38.19 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.5 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.03 
 
 		 235 aa  128  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.58 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  37.68 
 
 		 261 aa  128  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.02 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  39.11 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.81 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  35.85 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.33 
 
 		 243 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  37.73 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.98 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  40.1 
 
 		 212 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  37.8 
 
 		 207 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  36.87 
 
 		 263 aa  124  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  37.25 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  38.03 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.98 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.24 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.57 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.94 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.68 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.22 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  35.56 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  36.32 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  36.32 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  36.32 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.93 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  36.57 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.82 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.19 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  36.57 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  36.36 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  36.11 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  34.5 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.36 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  34.21 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.02 
 
 		 252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.63 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  33.77 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.75 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  35.51 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  37.43 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  35.96 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.22 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  34.35 
 
 		 233 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  33.63 
 
 		 250 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  33.76 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  36.74 
 
 		 224 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  33.48 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.55 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  32.49 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  33.91 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.48 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  34.5 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  36.28 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  32.49 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  37.33 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  33.92 
 
 		 241 aa  115  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  34.05 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>