More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0069 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  100 
 
 
217 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  47.73 
 
 
198 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  50.35 
 
 
189 aa  140  2e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.96 
 
 
213 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  44.14 
 
 
225 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  40.83 
 
 
181 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 
201 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.08 
 
 
209 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  42.51 
 
 
178 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.7 
 
 
190 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  40.74 
 
 
186 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
188 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  44.03 
 
 
185 aa  121  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  37.7 
 
 
193 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.14 
 
 
201 aa  120  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  45.93 
 
 
189 aa  120  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  38.25 
 
 
225 aa  121  1e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
206 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
206 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
206 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  40.12 
 
 
206 aa  120  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  42.68 
 
 
211 aa  120  2e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  44.06 
 
 
181 aa  119  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  45.32 
 
 
186 aa  119  5e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 
199 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.13319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  36.63 
 
 
208 aa  118  8e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  38.32 
 
 
210 aa  117  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.51 
 
 
206 aa  118  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.04 
 
 
181 aa  117  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40.26 
 
 
200 aa  117  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40 
 
 
208 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 
206 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  43.92 
 
 
210 aa  114  1e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  38.22 
 
 
204 aa  114  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  40 
 
 
218 aa  113  2e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
203 aa  113  2e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
205 aa  113  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
195 aa  113  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.04 
 
 
206 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  36.49 
 
 
173 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  39.35 
 
 
203 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.13 
 
 
181 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 
192 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  40.27 
 
 
188 aa  112  4e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  43.75 
 
 
181 aa  112  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.97 
 
 
209 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.46 
 
 
213 aa  111  7e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  40.67 
 
 
198 aa  111  7e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 
210 aa  111  8e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  40 
 
 
187 aa  111  8e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  111  1e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  110  1e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  111  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  111  1e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  111  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  40.13 
 
 
221 aa  111  1e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  110  1e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.06 
 
 
187 aa  111  1e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
188 aa  111  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  38.89 
 
 
200 aa  109  2e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  35.94 
 
 
187 aa  110  2e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  37.56 
 
 
187 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.88 
 
 
194 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  43.06 
 
 
186 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.09 
 
 
260 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  38.56 
 
 
240 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 
210 aa  109  4e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 
212 aa  108  4e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  42.67 
 
 
226 aa  109  4e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.96 
 
 
207 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.71 
 
 
204 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  43.45 
 
 
179 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  37.37 
 
 
192 aa  108  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  42.38 
 
 
230 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 
200 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
192 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  42.96 
 
 
230 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 
199 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.43 
 
 
225 aa  108  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  42.25 
 
 
228 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  38.89 
 
 
186 aa  108  7e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  33.65 
 
 
206 aa  108  9e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  38 
 
 
199 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  37.65 
 
 
207 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
222 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  39.72 
 
 
194 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
198 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  44.44 
 
 
171 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  44.2 
 
 
180 aa  106  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  41.78 
 
 
187 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 
195 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 
206 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  44.44 
 
 
171 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  36 
 
 
184 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.42 
 
 
204 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  37.16 
 
 
194 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  37.91 
 
 
197 aa  105  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  38.1 
 
 
226 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.36 
 
 
207 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.84 
 
 
198 aa  105  6e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>