More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_863 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  96.02 
 
 		 176 aa  338  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  92.61 
 
 		 176 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  40.72 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  37.67 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.05 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.98 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  40.85 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  40.4 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  40 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.02 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.65 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  37.23 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.07 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  33.89 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 174 aa  99.4  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  38.04 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  43.57 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  36.48 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 184 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>