More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_273 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  91.96 
 
 		 311 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  92.93 
 
 		 311 aa  577  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 328 aa  297  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  51.68 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  48.82 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  48.07 
 
 		 285 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  46.36 
 
 		 309 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  45.31 
 
 		 315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  45.58 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  43.38 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  39.86 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  47.93 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  39.5 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  40.7 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  36.82 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  37.01 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 460 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  37.69 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 459 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  37.89 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  37.28 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  36.57 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  38.25 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 295 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  38.25 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  34.11 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  34.14 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 		 483 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.78 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  30.95 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.71 
 
 		 459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  34.38 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  31.7 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  33.1 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  34.67 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  36.17 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  36.53 
 
 		 339 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  35.32 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  36.33 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  38.69 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.34 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  31.79 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  33.09 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  31.31 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  34.3 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  30.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  30.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  29.28 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.69 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  28.67 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.6 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.95 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.69 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>