More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0473 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  100 
 
 		 453 aa  932    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.54 
 
 		 451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.84 
 
 		 482 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 482 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.84 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 482 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 481 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.42 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.48 
 
 		 481 aa  272  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.49 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.49 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.42 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.88 
 
 		 486 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.26 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.84 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.13 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.76 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.9 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.09 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.9 
 
 		 491 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.58 
 
 		 494 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.96 
 
 		 513 aa  203  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.04 
 
 		 528 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 485 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 505 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 507 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 525 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 487 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.53 
 
 		 525 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  31.75 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 525 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 		 491 aa  193  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 496 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 504 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  26.04 
 
 		 514 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.35 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 508 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 		 525 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 530 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  28.51 
 
 		 500 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 510 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 502 aa  186  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 518 aa  186  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 561 aa  186  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 578 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  28.83 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 546 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.35 
 
 		 503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.87 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 530 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 530 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 501 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  28.16 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.34 
 
 		 570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 1043 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 585 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 526 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 509 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.54 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 		 502 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>