More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0162 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  304  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  78.85 
 
 		 158 aa  243  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  76.28 
 
 		 158 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  70.13 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  69.87 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  65.16 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  66.45 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  67.95 
 
 		 159 aa  183  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  69.93 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  64.47 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  57.14 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  56.25 
 
 		 161 aa  156  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  53.69 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  52 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  52.45 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  49.68 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  52.74 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 156 aa  126  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  48.63 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 172 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  50.71 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.71 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  44.81 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  42.28 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  41.56 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>