More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0070 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 
356 aa  709  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  50.3 
 
 
323 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  44.72 
 
 
365 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  45.51 
 
 
339 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  43.88 
 
 
329 aa  242  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 
339 aa  154  3e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.66 
 
 
323 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  35.73 
 
 
324 aa  148  1e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  36.23 
 
 
323 aa  147  2e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  36.45 
 
 
329 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  3.1057e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 
319 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  38.24 
 
 
328 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  35.51 
 
 
333 aa  142  1e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  34.54 
 
 
332 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.8 
 
 
327 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  34.05 
 
 
334 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.02219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  31.96 
 
 
329 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1488  thiamine-monophosphate kinase  32.92 
 
 
305 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0719227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 
323 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.40757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1366  thiamine-monophosphate kinase  34.93 
 
 
314 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.192549  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 
323 aa  135  1e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  33.14 
 
 
323 aa  135  1e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
323 aa  134  2e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.84 
 
 
323 aa  133  4e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  34.35 
 
 
319 aa  133  4e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  2.16996e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
318 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
318 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.58 
 
 
358 aa  132  7e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.27 
 
 
318 aa  132  8e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
344 aa  132  1e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  30.42 
 
 
332 aa  132  1e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  37.86 
 
 
331 aa  131  2e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 
326 aa  131  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  32.35 
 
 
315 aa  131  2e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.4 
 
 
323 aa  131  2e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  32.44 
 
 
318 aa  130  2e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  37.27 
 
 
324 aa  130  4e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 
323 aa  130  4e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  31.19 
 
 
306 aa  129  7e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  31.98 
 
 
318 aa  129  8e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  31.1 
 
 
350 aa  128  1e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
322 aa  127  2e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 
315 aa  127  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  32.35 
 
 
335 aa  128  2e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.11831e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 
331 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  34.43 
 
 
319 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  38.33 
 
 
324 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  31.97 
 
 
319 aa  127  4e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.68907e-05  unclonable  8.63796e-11 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11460  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 
322 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0770171  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 
337 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.21 
 
 
318 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  30.6 
 
 
336 aa  125  8e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  36.44 
 
 
332 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  31.82 
 
 
346 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 
325 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 
325 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  38.73 
 
 
324 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 
300 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  32.95 
 
 
330 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3288  thiamine monophosphate kinase  32.83 
 
 
316 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  34.32 
 
 
327 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  30.88 
 
 
325 aa  122  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  28.27 
 
 
336 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  9.67577e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 
334 aa  122  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  35.82 
 
 
319 aa  122  1e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 
333 aa  122  1e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  34.41 
 
 
375 aa  121  2e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  32.85 
 
 
329 aa  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  34.06 
 
 
317 aa  121  2e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  32.85 
 
 
329 aa  121  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 
318 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  7.43717e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  32.56 
 
 
329 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  27.95 
 
 
355 aa  120  5e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  35.91 
 
 
333 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  28.78 
 
 
336 aa  119  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  36.02 
 
 
335 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  31.4 
 
 
337 aa  118  1e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  4.70435e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  34.43 
 
 
332 aa  119  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  35.4 
 
 
332 aa  118  1e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  31.61 
 
 
318 aa  118  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  30.48 
 
 
340 aa  117  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.14 
 
 
348 aa  118  2e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  31.01 
 
 
369 aa  118  2e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  32.73 
 
 
321 aa  117  2e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  35.08 
 
 
321 aa  118  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  30.74 
 
 
321 aa  117  2e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  32.82 
 
 
316 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  33.91 
 
 
324 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.02 
 
 
320 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  35.49 
 
 
319 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5985  thiamine-monophosphate kinase  31.97 
 
 
321 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  32.56 
 
 
324 aa  117  4e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0085  thiamine-monophosphate kinase  26.14 
 
 
314 aa  117  4e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000254711  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  34.81 
 
 
338 aa  117  4e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  40.17 
 
 
333 aa  117  4e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>