More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3111 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3111  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 404 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  63.37 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0084  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  58.04 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3034  L-serine ammonia-lyase  56.39 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2070  serine dehydratase alpha chain  50.51 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1327  serine dehydratase alpha chain  52.03 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016553 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3112  serine dehydratase alpha chain  46.23 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0667312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  44.59 
 
 		 458 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  42.26 
 
 		 458 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  41.99 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  43.4 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  42.73 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  42.21 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  42.21 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  43.11 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  41.54 
 
 		 460 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  43.52 
 
 		 463 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  39.87 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  40.4 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  42.6 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2808  L-serine dehydratase  42.92 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.255142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33030  L-serine dehydratase  42.27 
 
 		 458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.518916  hitchhiker  0.000319155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  38.75 
 
 		 499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 		 457 aa  302  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4231  L-serine dehydratase 1  41.78 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0897  L-serine dehydratase 1  41.18 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266509  normal  0.482369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  40.18 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0569  L-serine ammonia-lyase  39.01 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0531592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  40.62 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  41.5 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  42.11 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3620  L-serine dehydratase 1  41.79 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.294532  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  39.74 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0987  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 		 458 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  41.56 
 
 		 458 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  41.41 
 
 		 459 aa  299  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0854  hypothetical protein  39.11 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4393  L-serine ammonia-lyase  41.78 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  39.51 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0430  L-serine dehydratase 1  42.05 
 
 		 465 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  40.18 
 
 		 458 aa  298  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  41 
 
 		 458 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  40.66 
 
 		 464 aa  298  9e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02760  L-serine ammonia-lyase  41.25 
 
 		 472 aa  298  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  39.51 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0828  hypothetical protein  39.2 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1304  L-serine dehydratase 1  41.83 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039374  normal  0.309635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  43.05 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  43.78 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  39.91 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  40.8 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  39.29 
 
 		 458 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  41.98 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  39.29 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  43.05 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  38.73 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  39.37 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  38.53 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  40.56 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3164  L-serine dehydratase 1  42.6 
 
 		 458 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  39.62 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  39.42 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3591  L-serine dehydratase 1  39.1 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  39.07 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  40.35 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  39.42 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  41.72 
 
 		 504 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  38.63 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  41.45 
 
 		 461 aa  292  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  41.72 
 
 		 545 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  40.78 
 
 		 462 aa  292  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  41.76 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  38.51 
 
 		 458 aa  292  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  40.97 
 
 		 461 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1754  L-serine ammonia-lyase  41.2 
 
 		 458 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.244789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  41.1 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3884  L-serine dehydratase 1  40.88 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  41.02 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0116  L-serine dehydratase 1  40.62 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  40.49 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2016  L-serine dehydratase 1  40.69 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  39.64 
 
 		 454 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  39.64 
 
 		 454 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  42.16 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  38.22 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  40.75 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  40.66 
 
 		 462 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  42.6 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  40.13 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  41.5 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  40.67 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0052  L-serine ammonia-lyase  42.07 
 
 		 462 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0082  L-serine ammonia-lyase  41.32 
 
 		 489 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>