More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0023 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  39.84 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  40.45 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.73 
 
 		 372 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  40.09 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  38.4 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  38.22 
 
 		 413 aa  165  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  40.27 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  41.52 
 
 		 382 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  37 
 
 		 377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  37 
 
 		 377 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  40.87 
 
 		 366 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  40.97 
 
 		 375 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 		 366 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  39.55 
 
 		 366 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.72 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  38.93 
 
 		 393 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  40.18 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  39.15 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  39.07 
 
 		 430 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  38.7 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  38.26 
 
 		 386 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  38.57 
 
 		 384 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  38.02 
 
 		 376 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  35.53 
 
 		 365 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 382 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  35.08 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  35.08 
 
 		 382 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  40.47 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  36.23 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  36.55 
 
 		 384 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  37.38 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.89 
 
 		 368 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  38.57 
 
 		 387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  36.74 
 
 		 406 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  37.96 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  40.83 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  40.39 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  37.96 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  40.19 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  40.19 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  39.55 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  38.6 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  36.49 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  38.05 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  36.84 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  33.97 
 
 		 383 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  36.16 
 
 		 370 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  37.5 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  33.61 
 
 		 374 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.09 
 
 		 376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  33.61 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  40.47 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  41.12 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  36.77 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  40.53 
 
 		 362 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  38.1 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  34.4 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  35.71 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  38.28 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  41.44 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  37.14 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  36.24 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  32.09 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  36.49 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  38.15 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  36.96 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  36.65 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  37.85 
 
 		 382 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  36.45 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  37.26 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  38.5 
 
 		 386 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  39.91 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  39.71 
 
 		 379 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  36.89 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  36.89 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  40 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  34.96 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  38.92 
 
 		 385 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  40.48 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  35.93 
 
 		 382 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  38.81 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  37.79 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  38.21 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  36.48 
 
 		 378 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.45 
 
 		 396 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  35.02 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37.21 
 
 		 384 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  38.81 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.45 
 
 		 372 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.02 
 
 		 369 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  34.91 
 
 		 388 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  38.81 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  35.81 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  32.51 
 
 		 377 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  35.02 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>