More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3111 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  45.06 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  43.39 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  43.59 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0009  hypothetical protein  43.16 
 
 		 246 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1133  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 299 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  38.22 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0189  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  35.33 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 216 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  32.64 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  37.96 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  42.55 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.56 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  37.59 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.05 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.61 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.07 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  36.15 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.22 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  31.52 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.79 
 
 		 213 aa  62  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.29 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.72 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.57 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.79 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2820  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.79 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.61 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  36.03 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.66 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  37.74 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1355  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.632641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4330  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.510233  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  36.7 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>