More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2135 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 519 aa  1051    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  63.37 
 
 		 519 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  60.12 
 
 		 516 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  60.74 
 
 		 518 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  63.06 
 
 		 517 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  54.14 
 
 		 519 aa  537  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.92 
 
 		 530 aa  535  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 		 536 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.57 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  49.23 
 
 		 525 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  51.36 
 
 		 543 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 546 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  49.72 
 
 		 534 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  49.71 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 533 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 		 532 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  46.68 
 
 		 532 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  43.11 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  42.42 
 
 		 545 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  47.35 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 542 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 		 537 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.94 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  43.02 
 
 		 531 aa  362  8e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  38.53 
 
 		 700 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.25 
 
 		 640 aa  342  8e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 520 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.22 
 
 		 602 aa  331  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 543 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 		 552 aa  322  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  39.36 
 
 		 798 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  39.26 
 
 		 668 aa  309  6.999999999999999e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 574 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.9 
 
 		 591 aa  291  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.6 
 
 		 567 aa  287  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 578 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 		 573 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 639 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 573 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 600 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 603 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.39 
 
 		 585 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.4 
 
 		 554 aa  272  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 568 aa  269  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 582 aa  269  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 579 aa  269  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 		 581 aa  269  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  34.97 
 
 		 559 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 583 aa  266  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  35.8 
 
 		 585 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 		 579 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 		 579 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 583 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 562 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 579 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 575 aa  261  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.43 
 
 		 605 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.85 
 
 		 529 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.8 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  36.98 
 
 		 525 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.82 
 
 		 587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 576 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 556 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 582 aa  253  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 595 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 559 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 585 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.4 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 557 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 554 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 		 567 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 560 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 522 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>