More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0907 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  100 
 
 		 383 aa  764    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  52.27 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  51.6 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  52.14 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  50.8 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.4 
 
 		 384 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  53.6 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.27 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.33 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  51.6 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  51.47 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  51.06 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  50.27 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  53.85 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  51.74 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  51.21 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.86 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  48.28 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.6 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  47.45 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  44.95 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  48.79 
 
 		 383 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  48.56 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  50.78 
 
 		 409 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  48.56 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  48.56 
 
 		 381 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  48.29 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  48.56 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  48.92 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  47.45 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  53.12 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  47.37 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  48.26 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  48.29 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  48.03 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  48.29 
 
 		 381 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  45.31 
 
 		 393 aa  349  6e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 381 aa  347  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  48.03 
 
 		 381 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.36 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.55 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  47.77 
 
 		 381 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  50.94 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.11 
 
 		 393 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 392 aa  342  5.999999999999999e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  50.68 
 
 		 403 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  48.78 
 
 		 380 aa  338  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  50.68 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  50.68 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 393 aa  335  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 380 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  50.41 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  47.07 
 
 		 407 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.46 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  48.9 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  46.54 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.71 
 
 		 407 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.71 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  47.98 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.09 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  47.44 
 
 		 405 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.09 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  46.87 
 
 		 379 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  47.3 
 
 		 379 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.19 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.76 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  46.52 
 
 		 405 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.76 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.76 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  47.14 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  46.36 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.36 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.36 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  49.31 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  45.72 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  46.65 
 
 		 388 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  45.16 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.52 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  46.42 
 
 		 411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.32 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  46.03 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  45.99 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.32 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  48.23 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  40.37 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  47.53 
 
 		 408 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>