More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0429 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  76 
 
 		 247 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  75.56 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  76.36 
 
 		 252 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  75.56 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  75.56 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  75.56 
 
 		 250 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  75.56 
 
 		 247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.45 
 
 		 260 aa  331  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 282 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 282 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  75.45 
 
 		 291 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 273 aa  327  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  74.55 
 
 		 229 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  74.09 
 
 		 229 aa  322  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.27 
 
 		 230 aa  317  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.2 
 
 		 235 aa  315  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.2 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.54 
 
 		 223 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  72.2 
 
 		 224 aa  309  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  72.2 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  71.88 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  71.88 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.75 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  71.49 
 
 		 224 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  69.51 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  69.51 
 
 		 223 aa  299  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  70.59 
 
 		 224 aa  297  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  73.09 
 
 		 232 aa  292  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  69.06 
 
 		 226 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.27 
 
 		 224 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  57.14 
 
 		 224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.75 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  53.81 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.34 
 
 		 227 aa  224  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  53.36 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  53.36 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  53.36 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  53.36 
 
 		 252 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  53.36 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.27 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  53.36 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 239 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  54.38 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.09 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  52.73 
 
 		 223 aa  215  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  49.55 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  52.51 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  52.51 
 
 		 223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  50.23 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 266 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3340  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 220 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  50.68 
 
 		 223 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  56.42 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  49.77 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.68 
 
 		 223 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  55.96 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>