More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0037 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0037  N-acetylglucosamine kinase  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  63.64 
 
 
299 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  64.75 
 
 
301 aa  358  7e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2216  N-acetylglucosamine kinase  59.38 
 
 
329 aa  335  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0616096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  57.29 
 
 
307 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  54.85 
 
 
302 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  55.25 
 
 
301 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  55.93 
 
 
313 aa  322  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  54.92 
 
 
313 aa  322  6e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  58.11 
 
 
299 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  52.84 
 
 
304 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  52.33 
 
 
302 aa  315  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  52.33 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  53.85 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  57.97 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  51.33 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  51.33 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  51.33 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  60.14 
 
 
282 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  58.45 
 
 
310 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  56.9 
 
 
305 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  52 
 
 
302 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  52 
 
 
302 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  51.67 
 
 
302 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  59.46 
 
 
301 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  52 
 
 
302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  51.67 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  51.67 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  51.67 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  51.67 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  51.67 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  51.67 
 
 
302 aa  308  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  51.51 
 
 
301 aa  308  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  51.33 
 
 
331 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  52.86 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  54.73 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  54 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  53 
 
 
303 aa  298  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  55.22 
 
 
318 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  57.24 
 
 
305 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  57.24 
 
 
321 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  52.86 
 
 
307 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  48.48 
 
 
298 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  53.64 
 
 
306 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  51.35 
 
 
301 aa  288  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1405  fructokinase  52.88 
 
 
310 aa  287  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0354398  normal  0.0424092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  49.49 
 
 
299 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  51.35 
 
 
326 aa  285  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  51.01 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  52.7 
 
 
299 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  51.69 
 
 
296 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1371  fructokinase  51.16 
 
 
305 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  50.17 
 
 
301 aa  275  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2877  fructokinase  50.17 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000443813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1475  fructokinase  50.17 
 
 
305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1506  fructokinase  49.83 
 
 
305 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1470  fructokinase  49.83 
 
 
305 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2616  fructokinase  49.34 
 
 
306 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2683  fructokinase  49.34 
 
 
306 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  49.01 
 
 
312 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2790  fructokinase  49.34 
 
 
306 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00939579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  50 
 
 
298 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  49.66 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  49.66 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  49.66 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1656  fructokinase  49.34 
 
 
306 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  49.66 
 
 
300 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1428  fructokinase  52.03 
 
 
296 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.157147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2603  fructokinase  52.53 
 
 
300 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  49.83 
 
 
307 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  53 
 
 
302 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  50.57 
 
 
261 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  44.26 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  43.19 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1202  ROK family protein  53.9 
 
 
298 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  42.86 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.8 
 
 
304 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  40.8 
 
 
304 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.8 
 
 
302 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  39.8 
 
 
306 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  46.13 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  40.54 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  45.18 
 
 
304 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.46 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  42.19 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.19 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.19 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.19 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  42.19 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  41.86 
 
 
303 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  37.46 
 
 
302 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  38.8 
 
 
302 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  44.19 
 
 
310 aa  208  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0351  ROK family protein  42.76 
 
 
304 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000106958 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  41.86 
 
 
307 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  40.21 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  45.15 
 
 
298 aa  195  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  36.54 
 
 
305 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  42.14 
 
 
307 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  39.13 
 
 
304 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>