More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2529 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  36.67 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  40.26 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  40.23 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 116 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  39.19 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0620  transcriptional regulator, ArsR family  35.63 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000817029  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  39.08 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  30.86 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  41.67 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  33.73 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.14 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  35.71 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  43.42 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.84 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  32.93 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5478  ArsR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.350529  hitchhiker  0.00151942 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5558  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3836  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  29.67 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1665  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>