More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2228 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  69.57 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  65 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  64.48 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  64.61 
 
 		 186 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  62.94 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  47.78 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  47.31 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  48.86 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  48.86 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  48.86 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  47.8 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  46.67 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  46.67 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  58.66 
 
 		 209 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  48 
 
 		 186 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  46.45 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  47.22 
 
 		 184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  46.86 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  48.31 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  46.24 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  41.45 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  43.68 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  40.93 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  47.43 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  45.14 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  44.26 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  47.13 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  45.71 
 
 		 187 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  44.83 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  43.98 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  40.56 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.74 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  40.2 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  37.16 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  40.11 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  39.33 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  44.2 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  38.55 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  38.38 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  39.66 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.09 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  41.36 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  38.67 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  40.66 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  41.34 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  35.96 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36.16 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  38.25 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  38.8 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  37.7 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.39 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  34.66 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  36.67 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.66 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.64 
 
 		 180 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.78 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  35.52 
 
 		 183 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.63 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.16 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  42.62 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  35.12 
 
 		 441 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.59 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.07 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  38.8 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.52 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.34 
 
 		 173 aa  101  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  33.16 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  34.43 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.52 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.47 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  29.51 
 
 		 183 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  40.34 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  40.34 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  39.11 
 
 		 177 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  31.09 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  33.33 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  28.89 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  36.9 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  35.75 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  36.52 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  32.99 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  35.96 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.86 
 
 		 175 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  34.86 
 
 		 174 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.86 
 
 		 175 aa  91.7  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  33.52 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  36.09 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4656  cytochrome B561  39.08 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.282732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>