139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0403 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  57.34 
 
 		 228 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  66.97 
 
 		 222 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  66.06 
 
 		 222 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  60.45 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  58.6 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  55.61 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  55.25 
 
 		 219 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  42.54 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  39.91 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  48.65 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  48.39 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  47.22 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  36.92 
 
 		 221 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  41.18 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  36.02 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  35.81 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  37.23 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  38.32 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  38.07 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  44.17 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  36.84 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  35.98 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  36.84 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  38.83 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  36.32 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  37.67 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  36.32 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  42.42 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  43.62 
 
 		 193 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  43.55 
 
 		 199 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  43.55 
 
 		 199 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  40.32 
 
 		 219 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  41.11 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  36.87 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  38.14 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  37.73 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  38.14 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  37.68 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  36.28 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  37.67 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  41.8 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  42.99 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  32.35 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  34.82 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  33.19 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  37.63 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  33.52 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  36.92 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  32.88 
 
 		 387 aa  95.5  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  34.25 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  38.8 
 
 		 363 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  39.91 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  39.37 
 
 		 349 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  38.8 
 
 		 363 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  30.77 
 
 		 202 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  34.47 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  39.2 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  32.62 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  32.49 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  30.98 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  32.99 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  32.99 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  32.99 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  32.99 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  35.11 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  38.74 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  26.27 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  38.74 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  32.02 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  34.69 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  31.09 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  33.01 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  31.07 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.25 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  28.9 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  30.43 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  29.74 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  34.9 
 
 		 210 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  25.78 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  25.78 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  31.12 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  28.5 
 
 		 198 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  32.24 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  35.66 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  29.35 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  28.64 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  29.9 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  29.85 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  31.52 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  30.56 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  25.45 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  29.55 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  24.67 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2692  cytochrome B561  25.1 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000585757  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  36.22 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  35.82 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  30 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  27.17 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  36.18 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>