More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0709 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0709  trigger factor  100 
 
 		 448 aa  905    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  92.19 
 
 		 447 aa  840    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  89.29 
 
 		 447 aa  817    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.35 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.1 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.14 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.56 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.22 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.57 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.57 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.06 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.06 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.28 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.69 
 
 		 425 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.77 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.42 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  29.01 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.83 
 
 		 438 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  33.51 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.63 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.63 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.49 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.03 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  30.51 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.21 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.57 
 
 		 439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.01 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.99 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.5 
 
 		 460 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.54 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  29.09 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.72 
 
 		 484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.75 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.97 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.79 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.54 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.72 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  29.46 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  30.51 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.55 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.47 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  26.6 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.65 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.33 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  29.25 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.95 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.06 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.44 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.18 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  26.99 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  26.99 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  30.06 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  30.06 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  30.06 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  26.04 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.03 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.4 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.2 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  27.78 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.97 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.39 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  28.83 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.57 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  26.63 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.53 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.87 
 
 		 437 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  25.19 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  26.4 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.03 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.92 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  26.91 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  26.4 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.58 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.13 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  26.91 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  30.22 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  26.08 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  26.49 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  24.69 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  24.76 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.5 
 
 		 429 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.7 
 
 		 441 aa  142  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  29.26 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  29.23 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  28.2 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  26.87 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>