More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0007 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 
285 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
285 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
278 aa  233  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  46.49 
 
 
279 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 
287 aa  232  7e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 
278 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  41.97 
 
 
273 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.69 
 
 
280 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 
279 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 
283 aa  224  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 
277 aa  214  2e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
277 aa  214  2e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
291 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
292 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0934887  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
276 aa  196  5e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  39.25 
 
 
276 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
338 aa  195  8e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
314 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
317 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
306 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
267 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
278 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
269 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  39.33 
 
 
275 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.64 
 
 
273 aa  183  2e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
276 aa  182  4e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.24332e-12 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
272 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
291 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
291 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
291 aa  174  2e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
271 aa  173  2e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 
291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
268 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
291 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
291 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
273 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  4.06118e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.85 
 
 
271 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  35.84 
 
 
283 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.94 
 
 
275 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
281 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
291 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  35.48 
 
 
283 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 
286 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
291 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.42979e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 
291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
272 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
272 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
291 aa  166  3e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.09 
 
 
272 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
272 aa  166  6e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
280 aa  166  6e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
280 aa  165  7e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
344 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
272 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
271 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
268 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.76 
 
 
281 aa  165  1e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
278 aa  164  1e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
271 aa  162  4e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
285 aa  162  8e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 
280 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  39.54 
 
 
279 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
274 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
275 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
273 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
272 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.36 
 
 
277 aa  158  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  38.17 
 
 
274 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  36 
 
 
272 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
272 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
287 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
273 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
286 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  2.00632e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
274 aa  153  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  153  3e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
256 aa  153  3e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
291 aa  152  6e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
281 aa  152  6e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
271 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
270 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
284 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
272 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
277 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
277 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.59 
 
 
270 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
275 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
280 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
268 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.18039e-13  hitchhiker  1.72259e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.76 
 
 
272 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
267 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
284 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
258 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
258 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>