More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4442 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  80.65 
 
 
522 aa  828    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
525 aa  1072    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  50.48 
 
 
548 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 
552 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
552 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
552 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 
560 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 
537 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 
609 aa  366  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 
571 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
555 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 
566 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
567 aa  350  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
576 aa  350  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
555 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
532 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
530 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
562 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 
538 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 
544 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  37.23 
 
 
563 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
539 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
539 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 
530 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 
535 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  36.13 
 
 
586 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
616 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
539 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 
539 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
539 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
576 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 
539 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
595 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 
558 aa  330  4e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  38.81 
 
 
556 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  37.59 
 
 
528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 
528 aa  329  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.79 
 
 
528 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  37.78 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  37.79 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  37.79 
 
 
528 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  37.6 
 
 
528 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  37.1 
 
 
522 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
557 aa  326  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 
553 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  39.24 
 
 
541 aa  324  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
554 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  39.66 
 
 
555 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 
535 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  39.47 
 
 
541 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  39.47 
 
 
541 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  39.62 
 
 
555 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  39.62 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  39.62 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  39.62 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  37.13 
 
 
535 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
552 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
568 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  35.38 
 
 
568 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
557 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
546 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
557 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
562 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 
548 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  35.06 
 
 
551 aa  310  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
553 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
541 aa  309  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 
555 aa  309  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  39.35 
 
 
555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  39.34 
 
 
555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  36.02 
 
 
557 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 
555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
568 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
568 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  37.24 
 
 
556 aa  302  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
555 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 
568 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 
555 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
603 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
547 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
528 aa  299  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
539 aa  299  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
539 aa  299  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  35.71 
 
 
572 aa  299  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
543 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
547 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  35.53 
 
 
572 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
566 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
559 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 
559 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
554 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
571 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>