More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2155 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
631 aa  1284  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  38.79 
 
 
857 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.41 
 
 
688 aa  181  3e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  39.47 
 
 
447 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  38.76 
 
 
2313 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  37.43 
 
 
625 aa  116  1e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  36.21 
 
 
710 aa  113  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  36.36 
 
 
914 aa  111  4e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.52 
 
 
506 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  34.1 
 
 
518 aa  111  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  36.36 
 
 
939 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.54 
 
 
1821 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  35.8 
 
 
457 aa  107  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  39.1 
 
 
223 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.19 
 
 
4630 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  36.18 
 
 
1710 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  36.21 
 
 
526 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.29 
 
 
932 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.11 
 
 
693 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  36.94 
 
 
1081 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  35.16 
 
 
807 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.75 
 
 
920 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  39.24 
 
 
548 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  30.65 
 
 
1756 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  44.14 
 
 
758 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  36.77 
 
 
531 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.5922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.91 
 
 
1174 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  34.78 
 
 
542 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  37.74 
 
 
685 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.94 
 
 
1009 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  35.06 
 
 
604 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  33.53 
 
 
1208 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  36.36 
 
 
820 aa  98.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  33.7 
 
 
410 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  5.43314e-09  hitchhiker  1.17907e-15 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  35.71 
 
 
538 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  36.36 
 
 
520 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  33.55 
 
 
288 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  36.54 
 
 
921 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  34.46 
 
 
552 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
410 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.38501e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.64 
 
 
1226 aa  97.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 
1321 aa  97.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
410 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  8.72091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
410 aa  97.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.21919e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.29 
 
 
410 aa  97.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.64272e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  34.59 
 
 
548 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.01 
 
 
529 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  33.97 
 
 
531 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  34.64 
 
 
410 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  33.55 
 
 
926 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  32.96 
 
 
410 aa  95.5  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.0106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1008  cell-wall amidase, pXO2-42-like protein  33.15 
 
 
342 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  32.68 
 
 
530 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  3.64595e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
529 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.28713e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.57012e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.36 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.40449e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  32.47 
 
 
530 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.71 
 
 
529 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  3.34554e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  32.39 
 
 
1194 aa  94.4  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  35.43 
 
 
527 aa  94  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.86208e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34.51 
 
 
766 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  34.59 
 
 
1168 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  31.77 
 
 
343 aa  93.6  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1093  S-layer protein  32.29 
 
 
344 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  33.33 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.94264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  34.42 
 
 
341 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1021  S-layer protein  32.29 
 
 
346 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 
529 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  8.10888e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  33.33 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.69647e-08  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1177  putative S-layer protein  35.06 
 
 
344 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1195  S-layer protein, putative  34.42 
 
 
345 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  33.53 
 
 
375 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  33.99 
 
 
472 aa  92  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  1.16253e-08 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.61 
 
 
629 aa  91.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  35.29 
 
 
282 aa  91.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.62211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0974  S-layer protein  35.71 
 
 
819 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.42335e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0715  S-layer domain-containing protein  36.49 
 
 
879 aa  90.9  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  34.84 
 
 
396 aa  90.5  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  33.99 
 
 
472 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.21 
 
 
1328 aa  90.5  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  35.22 
 
 
615 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.56588e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  33.8 
 
 
542 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
1029 aa  89.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  25.34 
 
 
693 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  33.8 
 
 
779 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.61 
 
 
558 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.52 
 
 
573 aa  89  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  32.28 
 
 
660 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.40636e-07  hitchhiker  3.60107e-07 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  33.8 
 
 
765 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  33.33 
 
 
772 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  35.44 
 
 
863 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53738e-09 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  34.59 
 
 
767 aa  88.6  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  33.73 
 
 
524 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  31.48 
 
 
935 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  34.9 
 
 
822 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.77462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.15 
 
 
692 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  32.72 
 
 
1154 aa  87.8  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.57 
 
 
540 aa  87.8  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  33.12 
 
 
360 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  33.8 
 
 
546 aa  87.8  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>