More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1560 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  100 
 
 		 302 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  71.85 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  61.54 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0166  cysteine synthase family protein  61.54 
 
 		 302 aa  367  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.83 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  50.17 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  50.17 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  50.17 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  50.17 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  50.17 
 
 		 307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  49.5 
 
 		 307 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  49.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  49.83 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  50.17 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.5 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.17 
 
 		 307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  49.83 
 
 		 307 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.5 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  51 
 
 		 461 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  47.85 
 
 		 312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  46.89 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  47.85 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0885  cysteine synthase  47.52 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 298 aa  267  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  49.17 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  45.83 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  48.2 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  47.19 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  50.33 
 
 		 319 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  47.85 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1287  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  47.19 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.870324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  46.18 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  48.68 
 
 		 323 aa  257  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  46.05 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  44.22 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  45.85 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  45.85 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1759  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  48.84 
 
 		 303 aa  255  6e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  46.86 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  46.28 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  47.49 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  47.19 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  47.87 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  46.78 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  47.39 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.25 
 
 		 459 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  45.54 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  47.21 
 
 		 339 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  48.23 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  47.7 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  44.55 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  47.52 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  47.74 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  48.36 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  46.53 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  47.21 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  46.86 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  46.03 
 
 		 459 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  46.38 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2623  cysteine synthase A  43.93 
 
 		 329 aa  249  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  43.28 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  49.17 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  46.49 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.36 
 
 		 479 aa  247  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  46.23 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  46.53 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  46.82 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.72 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  45.87 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  46.6 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  48.84 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  46.89 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  44.3 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  47.54 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  46.73 
 
 		 313 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  47 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  46.2 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  48.23 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  46.73 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  49.18 
 
 		 314 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  46.69 
 
 		 479 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  48.24 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  46.15 
 
 		 320 aa  244  9e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  43.67 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  46.2 
 
 		 316 aa  244  9e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  45.54 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.95 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  45.7 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  45.54 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  45.57 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  45.87 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  43.23 
 
 		 311 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  45.21 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  45.03 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>