More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1331 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0913  aspartyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 582 aa  657    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.570744  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 588 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  65.94 
 
 		 592 aa  848    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 589 aa  641    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 594 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 597 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  75.17 
 
 		 593 aa  947    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 588 aa  703    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  735    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  52.97 
 
 		 589 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 593 aa  726    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  732    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  731    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 585 aa  717    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 619 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 599 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 592 aa  725    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 598 aa  800    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 597 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 598 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 588 aa  699    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 596 aa  735    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 		 594 aa  725    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 606 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  732    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 593 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 595 aa  1224    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 590 aa  731    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 		 588 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  60.03 
 
 		 600 aa  750    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 589 aa  648    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 600 aa  764    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 602 aa  699    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 587 aa  655    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 594 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 590 aa  739    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  58.36 
 
 		 591 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 593 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 598 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 627 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 600 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 598 aa  738    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 597 aa  791    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 		 597 aa  788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 597 aa  640    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 591 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 		 592 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 		 599 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 586 aa  752    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 589 aa  741    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 588 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 		 608 aa  777    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 614 aa  648    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 597 aa  697    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 		 613 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 592 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  58.06 
 
 		 601 aa  704    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 600 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 594 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 		 591 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  68.53 
 
 		 594 aa  851    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 591 aa  734    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 610 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 		 594 aa  744    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 626 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 593 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 600 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 600 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 600 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 599 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 596 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 599 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 595 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 595 aa  626  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 605 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 623 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 593 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000626629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 617 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 607 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0961  aspartyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0436213  normal  0.406742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>