254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0243 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
282 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  41.3 
 
 
483 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  44.37 
 
 
323 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  38.03 
 
 
452 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  41.44 
 
 
418 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  40.28 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  40.28 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  38.36 
 
 
450 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  37.67 
 
 
414 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.96 
 
 
657 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  38.19 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  39.82 
 
 
704 aa  95.9  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  44.74 
 
 
781 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  40.5 
 
 
289 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  41.82 
 
 
741 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
478 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  39.46 
 
 
481 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  39.58 
 
 
269 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  48.04 
 
 
948 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  40.28 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  41.73 
 
 
262 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  42.37 
 
 
758 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  44.21 
 
 
845 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  40.77 
 
 
418 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  37.72 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  36.81 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  41.59 
 
 
495 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  41.3 
 
 
514 aa  90.1  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  41.96 
 
 
113 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  40.15 
 
 
591 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  34.72 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  34.82 
 
 
429 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  38.18 
 
 
451 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  40.16 
 
 
732 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  38.74 
 
 
549 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  48.39 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.25 
 
 
657 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  35.77 
 
 
366 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  34.94 
 
 
340 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  40.71 
 
 
529 aa  85.9  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  36.05 
 
 
383 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  30.63 
 
 
763 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  34.51 
 
 
763 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 
175 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  36.94 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  38.32 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  41.58 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  34.21 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.63 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  33.77 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  32.61 
 
 
650 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  32.85 
 
 
451 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  31.03 
 
 
589 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  34.21 
 
 
792 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
784 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  35.09 
 
 
1176 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  28.42 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  41 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  33.88 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  34.72 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  36.28 
 
 
553 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  31.4 
 
 
421 aa  79  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.78 
 
 
907 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  36.75 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  38.39 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  35.04 
 
 
763 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  39.25 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  31.73 
 
 
521 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  34.71 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  39.64 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  38.46 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  34.81 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  45.1 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  38.89 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 
546 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 
625 aa  76.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  35.9 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  37.84 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  38.6 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  38.14 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  34.23 
 
 
784 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  31.67 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  35.24 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  41 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  36.19 
 
 
1305 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  45.05 
 
 
746 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  34.62 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  31.82 
 
 
652 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.38 
 
 
228 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  34.51 
 
 
751 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  37.5 
 
 
465 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  38.26 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>