70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0126 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  100 
 
 		 154 aa  306  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  67.53 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  51.3 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  42.11 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  34.42 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  32.89 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  32.48 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  30.92 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  30.92 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  31.58 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  32.89 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  30.22 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  29.91 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  33.07 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  26.85 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  30.43 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  29.5 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  33.03 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  31.43 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  25.32 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  30.43 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  31.3 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  31.09 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.93 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  28.06 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  29.29 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  25.68 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  27.81 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  29.29 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2232  CheC domain protein  29.37 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  29.69 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  28.12 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  29.2 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  30.47 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  28.12 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  28.12 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  28.12 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  28.12 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  26.81 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  27.34 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  27.34 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  27.34 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  26.56 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  26.43 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  24.5 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  27.48 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1986  chemotaxis protein CheX, putative  31.93 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  27.48 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  27.48 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4092  hypothetical protein  27.97 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0178506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.1 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2406  hypothetical protein  23.85 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  26.43 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  24.06 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2742  CheC domain protein  20.57 
 
 		 288 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00482165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.3 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  27.14 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  24.22 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.39 
 
 		 357 aa  44.3  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0308  hypothetical protein  30.89 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000030204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  27.2 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  22.96 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  27.72 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1606  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000014118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1476  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  32.47 
 
 		 94 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.76 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1373  hypothetical protein  27.08 
 
 		 288 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000882706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.6 
 
 		 229 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.41 
 
 		 346 aa  40.4  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>