45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1121 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 
509 aa  1052    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  47.16 
 
 
630 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  33.63 
 
 
549 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  33.18 
 
 
548 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  33.18 
 
 
548 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  34.39 
 
 
593 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  23.89 
 
 
639 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  33.76 
 
 
605 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  27.65 
 
 
529 aa  82.4  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  28.34 
 
 
552 aa  81.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  23.35 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  31.9 
 
 
549 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  30.37 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  31.31 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  23.08 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  22.75 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  24.91 
 
 
498 aa  67  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  39.52 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  22.93 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  24.27 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  33.1 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  31.13 
 
 
485 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  29.45 
 
 
465 aa  60.1  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  28.05 
 
 
477 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  32.91 
 
 
474 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  23.11 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  31.4 
 
 
471 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  21.27 
 
 
477 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  22.95 
 
 
520 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  23.16 
 
 
520 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  22.95 
 
 
520 aa  57.4  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  31.28 
 
 
412 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  22.95 
 
 
520 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  26.32 
 
 
478 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  32.73 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  35.51 
 
 
544 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  32.62 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  27.91 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  27.59 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  24.4 
 
 
482 aa  53.9  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  24.32 
 
 
750 aa  51.6  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  28.9 
 
 
533 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  31.35 
 
 
396 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  30.77 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  36.84 
 
 
471 aa  45.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>