42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0978 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  68.12 
 
 		 549 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  90.75 
 
 		 562 aa  1054    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 		 562 aa  1165    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  45.41 
 
 		 605 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  40.51 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  41.74 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  31.82 
 
 		 549 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  31.82 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  31.82 
 
 		 548 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  32.96 
 
 		 593 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  30.08 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  27.42 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  23.64 
 
 		 498 aa  99.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  22.84 
 
 		 483 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  22.82 
 
 		 497 aa  97.4  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  25.38 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  22.91 
 
 		 478 aa  93.6  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  21.82 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  24.33 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  21.94 
 
 		 473 aa  89.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  24.33 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  24.33 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  24.33 
 
 		 520 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  24.33 
 
 		 520 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  23.26 
 
 		 485 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  22.97 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  21.75 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  22.27 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  22.16 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  28 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  22.99 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  30.37 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  20.61 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  21.71 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  22.67 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  23.11 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  23.51 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  21.67 
 
 		 471 aa  62  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  28.57 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  20.63 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  22.54 
 
 		 507 aa  53.9  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  18.92 
 
 		 465 aa  53.5  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>