42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0754 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 
485 aa  997    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  42.3 
 
 
520 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  42.3 
 
 
520 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  42.3 
 
 
520 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  42.09 
 
 
520 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  42.09 
 
 
520 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  40.29 
 
 
498 aa  370  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  41.01 
 
 
497 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  35.85 
 
 
473 aa  278  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  33.12 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  36.19 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  32.99 
 
 
477 aa  239  6.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  36.5 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  35.19 
 
 
478 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  31.5 
 
 
535 aa  227  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  35.48 
 
 
483 aa  226  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  35.36 
 
 
474 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  33.85 
 
 
458 aa  223  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  31.98 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  34.7 
 
 
476 aa  217  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  31.52 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  33.74 
 
 
533 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  30.47 
 
 
482 aa  199  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  31.56 
 
 
507 aa  197  5.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  31.9 
 
 
471 aa  193  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  32.19 
 
 
544 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  33.17 
 
 
529 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  24.44 
 
 
639 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  26.92 
 
 
552 aa  122  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  26.71 
 
 
750 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  26.01 
 
 
605 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  25.51 
 
 
548 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  26.76 
 
 
593 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  25.1 
 
 
549 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  24.9 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  23.31 
 
 
562 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  25.16 
 
 
586 aa  80.1  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  23.48 
 
 
562 aa  77  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  29.68 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  23.26 
 
 
549 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  31.13 
 
 
509 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  29.38 
 
 
630 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>