18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0390 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 		 396 aa  791    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  37.88 
 
 		 415 aa  279  5e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0269  peptidase U34 dipeptidase  44.5 
 
 		 459 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  40.1 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  43.7 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  42.62 
 
 		 412 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0142  peptidase U34, dipeptidase  39.68 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0494  dipeptidase-like protein  48.06 
 
 		 166 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000183252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  33.57 
 
 		 548 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  33.57 
 
 		 549 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  32.86 
 
 		 548 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  31.35 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  25.68 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  35.16 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  24.85 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  25.68 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  36.11 
 
 		 630 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  25.51 
 
 		 562 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>