44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0965 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  69.2 
 
 
549 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 
562 aa  1167    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  90.75 
 
 
562 aa  1028    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  46.11 
 
 
605 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  40.34 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  40.94 
 
 
639 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  33.14 
 
 
549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  32.77 
 
 
548 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  32.58 
 
 
548 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  32.91 
 
 
593 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  30.45 
 
 
552 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  26.59 
 
 
586 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  22.84 
 
 
478 aa  98.6  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  22.48 
 
 
474 aa  96.3  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  23.46 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  23.96 
 
 
520 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  27.32 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  23.96 
 
 
520 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  23.96 
 
 
520 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  23.96 
 
 
520 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  24.15 
 
 
520 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  22.15 
 
 
497 aa  90.5  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  20.49 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  22.12 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  23.12 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  23.01 
 
 
533 aa  77.8  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  22.22 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  22.39 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  28.57 
 
 
630 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  21.76 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  22.45 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  31.31 
 
 
509 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  23.7 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  20.92 
 
 
458 aa  67  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  22.85 
 
 
544 aa  66.6  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  22.99 
 
 
529 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  22.69 
 
 
471 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  20.97 
 
 
476 aa  62  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  22.88 
 
 
507 aa  60.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  25.44 
 
 
437 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  19.78 
 
 
465 aa  56.2  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  20.75 
 
 
482 aa  48.1  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  24.19 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  25.23 
 
 
750 aa  43.5  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>