19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0527 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 
415 aa  865    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  42.2 
 
 
437 aa  362  8e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  37.88 
 
 
396 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0269  peptidase U34 dipeptidase  37.15 
 
 
459 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  36.7 
 
 
412 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  36.17 
 
 
412 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0142  peptidase U34, dipeptidase  34.42 
 
 
381 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0494  dipeptidase-like protein  50.39 
 
 
166 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000183252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  21.17 
 
 
639 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  27.59 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  29.71 
 
 
548 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  29.71 
 
 
549 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  29.71 
 
 
548 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  29.46 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  20.33 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  25.13 
 
 
630 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  23.23 
 
 
549 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  28.7 
 
 
544 aa  43.1  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  22.26 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>