32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  100 
 
 		 630 aa  1258    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  47.16 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  31.2 
 
 		 639 aa  90.9  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  27.59 
 
 		 605 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  28.57 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  28 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.32 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  24.01 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  24.69 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  30.52 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  32.84 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  28.57 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  33.33 
 
 		 549 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  29.58 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  31.1 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  21.85 
 
 		 483 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  34.07 
 
 		 474 aa  50.8  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  29.38 
 
 		 485 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  29.82 
 
 		 467 aa  47.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  25.13 
 
 		 415 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  32.28 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  32 
 
 		 476 aa  46.6  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  25.71 
 
 		 498 aa  45.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  28.12 
 
 		 520 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  30.15 
 
 		 465 aa  45.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  27.95 
 
 		 520 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  28.12 
 
 		 520 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  27.95 
 
 		 520 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  35.37 
 
 		 750 aa  44.3  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0390  peptidase U34, dipeptidase  36.11 
 
 		 396 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  29.86 
 
 		 412 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  29.17 
 
 		 412 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>