42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1240 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  100 
 
 
544 aa  1124    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  52.59 
 
 
533 aa  585  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  52.71 
 
 
535 aa  581  1e-164  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  51.94 
 
 
507 aa  524  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  46.94 
 
 
476 aa  503  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  46.48 
 
 
465 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  41.88 
 
 
474 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  37.34 
 
 
471 aa  330  3e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  35.11 
 
 
477 aa  326  7e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  35.92 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  35.11 
 
 
483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  34.31 
 
 
477 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  36.51 
 
 
478 aa  306  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  33.15 
 
 
474 aa  300  5e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  34.14 
 
 
471 aa  290  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  35.61 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  30.1 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  32.19 
 
 
485 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  30.09 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  27.48 
 
 
498 aa  172  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  25.68 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  28.08 
 
 
529 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  25.86 
 
 
549 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  23.61 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.94 
 
 
548 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  25.63 
 
 
548 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  25.17 
 
 
593 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  23.64 
 
 
639 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  30.95 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  22.85 
 
 
562 aa  67  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.69 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  22.96 
 
 
605 aa  63.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  23.33 
 
 
561 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  24.6 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  35.51 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  27.6 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  23.46 
 
 
549 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>