45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0185 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  100 
 
 
482 aa  995    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  34.11 
 
 
497 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  34.62 
 
 
473 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  31.87 
 
 
477 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  33.33 
 
 
498 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  30.79 
 
 
477 aa  216  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  34.29 
 
 
483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  32.86 
 
 
520 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  32.86 
 
 
520 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  32.24 
 
 
458 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  32.86 
 
 
520 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  32.86 
 
 
520 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  32.86 
 
 
520 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  30.52 
 
 
467 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  32.32 
 
 
474 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  29.64 
 
 
474 aa  205  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  30.47 
 
 
485 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  32.11 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  27.83 
 
 
476 aa  194  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  29.32 
 
 
529 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  27.27 
 
 
465 aa  179  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  27.45 
 
 
533 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  33.25 
 
 
750 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  26.55 
 
 
535 aa  172  9e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  28.85 
 
 
478 aa  169  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  31.69 
 
 
471 aa  160  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  25.68 
 
 
544 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  27.44 
 
 
507 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  24.17 
 
 
605 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  22.64 
 
 
639 aa  93.2  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  25.42 
 
 
549 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  25.42 
 
 
548 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.02 
 
 
548 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  24.06 
 
 
552 aa  90.5  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  23.84 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  25.48 
 
 
437 aa  67  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  21.91 
 
 
561 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  26.2 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  26.2 
 
 
412 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  20.63 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  21.51 
 
 
549 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  24.4 
 
 
509 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0527  peptidase U34, dipeptidase  20.33 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  20.75 
 
 
562 aa  48.5  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0494  dipeptidase-like protein  26.21 
 
 
166 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000183252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>