39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  100 
 
 
507 aa  1033    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  56.22 
 
 
535 aa  613  9.999999999999999e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  55.25 
 
 
533 aa  601  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  53.17 
 
 
476 aa  554  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  51.94 
 
 
544 aa  530  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  50.99 
 
 
465 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  43.96 
 
 
474 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  39.58 
 
 
458 aa  356  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  39.8 
 
 
471 aa  353  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  36.02 
 
 
477 aa  323  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  35.57 
 
 
483 aa  312  9e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  35.31 
 
 
477 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  32.06 
 
 
474 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  32.46 
 
 
478 aa  272  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  33.54 
 
 
471 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  33.49 
 
 
467 aa  249  7e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  29.07 
 
 
473 aa  227  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  30.41 
 
 
520 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  30.5 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  30.41 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  30.41 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  30.28 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  30.95 
 
 
485 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  28.27 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  28.83 
 
 
498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  27.44 
 
 
482 aa  153  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  25.44 
 
 
529 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  23.73 
 
 
549 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  23.73 
 
 
548 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  23.52 
 
 
548 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  24.29 
 
 
552 aa  89.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  22.31 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  21.62 
 
 
639 aa  74.7  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  22.59 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  23.18 
 
 
750 aa  67.4  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  22.52 
 
 
605 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  22.5 
 
 
562 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  22.73 
 
 
549 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.54 
 
 
562 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>