41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2978 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1167    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  41.03 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  40.34 
 
 		 562 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  40.03 
 
 		 562 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  38.16 
 
 		 605 aa  357  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  36.44 
 
 		 639 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  28.02 
 
 		 549 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  28.42 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  27.85 
 
 		 548 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  28.03 
 
 		 593 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  26.46 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  25 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  25.31 
 
 		 467 aa  93.6  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  22.96 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  24.44 
 
 		 476 aa  91.7  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  23.89 
 
 		 474 aa  90.5  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  23.94 
 
 		 529 aa  90.5  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  23.64 
 
 		 520 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  23.45 
 
 		 520 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  23.45 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  22.59 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  23.27 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  23.27 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  24.58 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  24.24 
 
 		 498 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  22.1 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  25.75 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  23.74 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  23.48 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  29.68 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  22.59 
 
 		 507 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  23.46 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  21.07 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  21.81 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  21.17 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  39.52 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  21.91 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  20.87 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  32.84 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  21.61 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  23.33 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>