42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1643 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  68.62 
 
 		 477 aa  695    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  100 
 
 		 477 aa  1004    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  45.38 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  43.88 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  44.98 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  43.24 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  44.4 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  41.95 
 
 		 467 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  42.56 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  38.31 
 
 		 535 aa  345  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  37.23 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  39.19 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  38.78 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  39.35 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  34.31 
 
 		 544 aa  311  2e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  38.05 
 
 		 471 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  34.38 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  34.68 
 
 		 520 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  34.67 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  34.26 
 
 		 497 aa  237  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  34.67 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  34.67 
 
 		 520 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  34.42 
 
 		 520 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  34.5 
 
 		 498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  36.5 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  31.87 
 
 		 482 aa  226  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  27.7 
 
 		 529 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  26.16 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  25.97 
 
 		 548 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  24.28 
 
 		 639 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  25.97 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  24.71 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  23.66 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  24.13 
 
 		 750 aa  100  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  22.95 
 
 		 605 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  22.78 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  21.97 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  25.75 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.27 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  25.12 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  21.27 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  26.88 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>