44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0913 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 
605 aa  1239    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  48.98 
 
 
639 aa  561  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  45.95 
 
 
562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  43.31 
 
 
549 aa  435  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  45.25 
 
 
562 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  38.16 
 
 
561 aa  357  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  34.87 
 
 
548 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  34.5 
 
 
549 aa  273  9e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  34.32 
 
 
548 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  36.93 
 
 
593 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  28.91 
 
 
552 aa  224  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  29.23 
 
 
586 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  23.61 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  23.61 
 
 
520 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  23.61 
 
 
520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  23.43 
 
 
520 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  23.77 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  25.24 
 
 
467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  25.05 
 
 
498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  23.91 
 
 
497 aa  103  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  22.69 
 
 
473 aa  101  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  26.01 
 
 
485 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  24.17 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  22.95 
 
 
477 aa  92  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  23.56 
 
 
477 aa  91.3  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  24.22 
 
 
478 aa  90.9  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  24 
 
 
483 aa  88.2  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  33.76 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  22.5 
 
 
474 aa  84  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  27.59 
 
 
630 aa  84  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  25.06 
 
 
471 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  24.43 
 
 
458 aa  82  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  24.09 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  24.28 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  23.44 
 
 
529 aa  75.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  22.05 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  22.11 
 
 
535 aa  67.4  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  22.96 
 
 
544 aa  63.5  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  21.85 
 
 
465 aa  57.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  21.49 
 
 
533 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  22.35 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  26.24 
 
 
750 aa  51.2  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61870  hypothetical protein  27.36 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5383  hypothetical protein  29.91 
 
 
412 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>