42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1272 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  73.42 
 
 
535 aa  836    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  100 
 
 
533 aa  1108    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  55.62 
 
 
507 aa  592  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  52.87 
 
 
544 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  54.8 
 
 
476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  50.19 
 
 
465 aa  535  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  45.09 
 
 
474 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  43.57 
 
 
458 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  40.54 
 
 
471 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  36.79 
 
 
477 aa  343  5e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  41.06 
 
 
477 aa  339  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  39.11 
 
 
483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  38.85 
 
 
474 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  36.16 
 
 
471 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  37.03 
 
 
478 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  37 
 
 
467 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  32.74 
 
 
473 aa  258  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  33.25 
 
 
520 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  33.25 
 
 
520 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  33.25 
 
 
520 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  33.25 
 
 
520 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  33.25 
 
 
520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  32.63 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  31.74 
 
 
497 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  31.74 
 
 
498 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  27.45 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  28.47 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  22.53 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  22.96 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  22.66 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  23.87 
 
 
548 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  23.01 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  22.89 
 
 
750 aa  70.5  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  22.51 
 
 
562 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  24.32 
 
 
593 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  23.25 
 
 
586 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  20.38 
 
 
639 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  22.13 
 
 
561 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  21.79 
 
 
605 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  27.23 
 
 
437 aa  57.8  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  20.7 
 
 
549 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  28.9 
 
 
509 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>