43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1169 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  100 
 
 		 520 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  99.62 
 
 		 520 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  99.62 
 
 		 520 aa  1087    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  99.62 
 
 		 520 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  99.23 
 
 		 520 aa  1086    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  51.34 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  49.26 
 
 		 498 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  42.3 
 
 		 485 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  38.14 
 
 		 467 aa  269  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  36.84 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  32.17 
 
 		 473 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  34.51 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  34.09 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  34.67 
 
 		 477 aa  237  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  33.75 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  33.33 
 
 		 465 aa  236  9e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  32.47 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  35 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  32.74 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  32.41 
 
 		 535 aa  220  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  33.25 
 
 		 533 aa  219  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  33.1 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  32.86 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  30.41 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  30.04 
 
 		 529 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  30.5 
 
 		 544 aa  184  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  31.02 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  25.53 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  28.17 
 
 		 750 aa  144  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  23.91 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  23.77 
 
 		 605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  25.46 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  24.9 
 
 		 548 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  24.69 
 
 		 549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  24.49 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  23.96 
 
 		 562 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  26.91 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  23.27 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  24.89 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  26.24 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  23.11 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02330  hypothetical protein  27.95 
 
 		 630 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  23.55 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>