42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0714 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0714  peptidase U34, dipeptidase  100 
 
 		 471 aa  988    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2584  dipeptidase  51.16 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000092042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0783  dipeptidase  49.37 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1689  peptidase U34, dipeptidase  47.6 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1643  dipeptidase  44.98 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0156326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1827  peptidase U34, dipeptidase  44.61 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1068  peptidase U34, dipeptidase  44.7 
 
 		 467 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000170165  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1783  dipeptidase A  39.45 
 
 		 476 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0968293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1652  dipeptidase A  38.87 
 
 		 474 aa  349  6e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1753  dipeptidase  39.92 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0534  dipeptidase  36.25 
 
 		 465 aa  317  4e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0255  dipeptidase  37.82 
 
 		 471 aa  313  5.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.175773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1272  dipeptidase  36.16 
 
 		 533 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0570  peptidase U34, dipeptidase  35.78 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00328479  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1262  peptidase family C69  35.25 
 
 		 535 aa  296  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00827684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1240  dipeptidase  34.14 
 
 		 544 aa  290  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05200  dipeptidase A  32.99 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0754  peptidase U34 dipeptidase  36.19 
 
 		 485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582134  normal  0.724376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0344  C69 family peptidase  34.67 
 
 		 497 aa  223  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1053  peptidase family C69  32.74 
 
 		 520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1158  peptidase family C69  32.74 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.466894  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1169  peptidase family C69  32.74 
 
 		 520 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.451747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1838  S-layer-RTX protein  34.09 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1189  peptidase family C69  32.74 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1204  peptidase family C69  32.74 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0185  peptidase U34 dipeptidase  32.11 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1447  peptidase U34 dipeptidase  29.61 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000509419  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3888  peptidase U34 dipeptidase  23.54 
 
 		 549 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3825  peptidase U34, dipeptidase  23.34 
 
 		 548 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3966  peptidase U34 dipeptidase  23.14 
 
 		 548 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1313  dipeptidase-related protein  23.33 
 
 		 552 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3441  peptidase U34 dipeptidase  23.23 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.534665  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  28.04 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1692  peptidase U34, dipeptidase  23.73 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2978  hypothetical protein  22.1 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0567036  normal  0.419431 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32733  predicted protein  23.85 
 
 		 586 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0913  peptidase U34, dipeptidase  22.05 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.453649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0965  peptidase U34 dipeptidase  22.69 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0978  peptidase U34 dipeptidase  21.77 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1121  peptidase U34, dipeptidase  31.4 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000424745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3577  peptidase U34 dipeptidase  22.02 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0764698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1497  peptidase U34, dipeptidase  22.78 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>